A Nature pode ajudar a deixar os atributos do seu Pokémon mais adequados ao estilo de batalha. Para alterá-la, use um dos itens disponíveis no jogo.

Nature Ticket — item usado para alterar a Nature do Pokémon. Pode ser conseguido através de Random Ticket.

Magical Hats (Card) — também pode conceder Nature Ticket. (evento Yu-Gi-Oh!)

Nature Spell Potion — mais uma opção para alterar a Nature do Pokémon. DG Aged 

DNA Surgery — também permite alterar a Nature do seu Pokémon e serve como alternativa ao Nature Ticket. (evento Yu-Gi-Oh!)

1. Tenha um Nature Ticket, Nature Spell Potion ou DNA Surgery.
2. Escolha o Pokémon que receberá a nova Nature.
3. Clica na pokebola do pokemon alterar a Nature.